Stephan Gunkel engagiert sich seit Jahren für lebendige naturnahe und saubere Gewässer, in denen auch wieder gebadet werden kann. Er ist (Mit-)Organisator von Flussbadeaktionen in Frankreich, Meiningen und Erfurt. Darüber hinaus betätigt er sich im Gewässerbeirat zur Umsetzung der WRRL im TMUEN, ist Geschäftsführer des Flussbüros Erfurt und hat 2014 eine Veröffentlichung zum Thema: Baden in der Saale? Wasserqualität, Badestellen, Potentiale, herausgebracht.